4月3日上午，中日舰队群浩浩荡荡地开向了位于吕宋岛西海岸中部蜂腰处的林加延湾，这里是南京军主力真正展开登陆的预定地点。林加延湾三面环路，港湾内一年四季风平浪静，海滩平缓而宽阔，无险可据、易攻难守，并且从港湾向内陆延伸近百公里都是多山的菲律宾境内少见的一片大平原，适合车辆驰骋，是菲律宾最理想的登陆地点。开战前，冯圣法一眼看中了这里，而麦克阿瑟也已经预料到中国军队十有八九会在林加延湾展开登陆，因此部署重兵在这里准备迎战，并且他还要求亚洲舰队司令托马斯哈特把舰队调到林加延湾与陆军并肩作战，陆海联合抗拒敌军。
麦克阿瑟是美国陆军远东部队司令兼菲律宾陆军总司令（菲律宾此时只有陆军，没有海军和空军），哈特是美国海军亚洲舰队总司令，两人平级，互相没有隶属关系，所以麦克阿瑟无权命令哈特，只能请求哈特。对于麦克阿瑟的请求，哈特感到很为难，他的舰队本就实力大不如中日舰队，又在日军空袭中损失很大，如果开到林加延湾，等于送死，但他知道海军应该跟陆军同仇敌忾，并且因为菲律宾四面环敌，亚洲舰队已经无路可去，也只能拼死一搏了。经过分析，哈特认为，水面军舰不能前去林加延湾，只能派潜艇出击，他随即找来亚洲舰队潜艇部队司令约翰威克斯少将。
威克斯不赞同哈特的看法，他认为，潜艇没办法跟水面军舰交战，潜艇的特长是偷袭，并且偷袭目标最好是敌方民船而不是敌方军舰，把潜艇派去林加延湾，等于强攻对方的舰队，这跟送死没区别，他不愿意让部下执行有去无回的任务。
哈特理解威克斯的难处，但他要求威克斯必须出击，他说道：“敌强我弱是事实，可是，我们也不能因此而避战畏战，麦克阿瑟的陆军需要我们，如果陆军在陆上打输了，我们又能去哪里了？菲律宾的北边是中国和日本的本土，西边和南边是中国和日本的占领区，东边是太平洋，并且夏威夷也丢了，难道我们最后要一枪不放地投降吗？”
在哈特的坚持下，威克斯勉为其难地同意，但打了很大折扣，只是派了6艘潜艇参战，出击前，威克斯对六位潜艇指挥官说道：“你们只需击沉甚至击伤一艘敌舰就可以了，我们就对陆军有个交代了，不需要硬拼，因为这个命令本来就是不理智的。”
因为长官自身就意愿不高、态度消极，所以出击的这六艘美军潜艇大部分都没有视死如归地参战，表现最英勇的是其中一艘“海狼号”，该潜艇小心翼翼地瞄准了中日舰队群里一艘位置靠边、体型较大的军舰，然后猛地发射了四枚鱼雷。此时，日军舰队正在进入港湾，准备炮击陆地，中国海军舰队跟在后面，所以被美军海狼号潜艇攻击的是日军军舰、排水量五千五百吨的五十铃号轻巡洋舰。六枚鱼雷四枚命中，顷刻间把五十铃号炸成一堆在海面上粉身碎骨和熊熊燃烧的钢铁熔炉。海浪号属于美军最先进的潜艇，使用的鱼雷也是美军最新研制的一种磁雷管引爆鱼雷，该鱼雷的威力虽然逊于日军的氧气鱼雷，但也十分强大，因此中了四枚的五十铃号立刻被炸沉。
日军舰队顿时惊慌失措，各军舰手忙脚乱地往海里投掷深水炸弹，折腾了半天也没有摧毁得手后已经潜伏在海里的海浪号。接到报告后的曾以鼎冷笑两声：“叫这帮小日本轻视反潜，现在吃苦头了吧？他们这样拖泥带水，浪费我们的时间，派两艘驱逐舰去帮帮日本人。”
第1舰队的海参崴号和海兰泡号驱逐舰随即离开舰队，开入林加延湾内参加搜寻美军潜艇的战斗。两艘驱逐舰开启舰上的德国声呐探测器，在疑似美军潜艇潜伏躲藏着的海域内反复搜索，没多久就发现了正在海面下一百多米处一动不动、试图装死逃脱的海浪号，然后一顿深水炸弹将其炸成浮在海面上的油污垃圾以及沉入海底的残骸碎片。
海浪号的沉没让其余美军潜艇更加丧失了参加战斗的勇气，纷纷撤离林加延湾。
解除美军潜艇的威胁后，在曾以鼎的催促下，井上成美命令日军战列舰、重型巡洋舰一起对预定登陆滩头展开炮击。半小时后，中国海军第1陆战师第11陆战旅的七千余官兵踏着齐腰深的海浪、踩着青烟袅袅并且一片焦黑的沙滩，顺利地登陆上岸。
负责在林加延湾一带指挥部队迎战敌军的是美军远东陆军副司令乔纳森温赖特少将，他也是麦克阿瑟在西点军校的校友和私人好友。温赖特兵力雄厚，他此时手握“十万大军”，但七成以上都是菲军。为了避免自家美军遭受太大伤亡，温赖特把菲军装备最好的第11师、第17师部署在最前面，然后命令这两个师“发挥保家卫国的精神和勇气，把侵略菲律宾的敌人赶下大海”。
温赖特的打算是“趁敌军刚刚上岸、立足未稳时给予其迎头痛击，一来打击敌军嚣张气焰，二来好好地振奋己方部队的军心士气”，但接下来爆发的战斗让温赖特深深地知道了什么叫做“以卵击石”和“一触即溃”。
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